Amidaas (AMD)
Ensüümid:Need on makromolekulaarsed bioloogilised katalüsaatorid, enamik ensüüme on valgud
Amidaas:Katalüüsige erinevate endogeensete ja võõraste alifaatsete ja aromaatsete amiidide hüdrolüüsi, kandes atsüülrühma vette vabade hapete ja ammoniaagi tootmisega.Hüdroksaamhappeid ja teisi orgaanilisi happeid kasutatakse laialdaselt ravimitena, kuna need on kasvufaktorite, antibiootikumide ja kasvaja inhibiitorite koostisosad.Vastavalt katalüsaatori stereoselektiivsusele võib amidaasid jagada R-tüüpi ja S-tüüpi atsülaasideks.
Lisaks amiidide hüdrolüüsi katalüüsimisele võib amidaas katalüüsida ka atsüüliülekande reaktsioone kaassubstraatide, näiteks hüdroksüülamiini juuresolekul.
Erinevate allikatega amidaasidel on erinev substraadi spetsiifilisus, mõned neist suudavad hüdrolüüsida ainult aromaatseid amiide, mõned neist ainult alifaatseid amiide ja mõned hüdrolüüsivad α- või ω-aminoamiide.Enamikul amiinidest on hea katalüütiline aktiivsus ainult atsükliliste või lihtsate aromaatsete amiidide puhul, kuid komplekssete aromaatsete ainete puhul on heterotsüklilised amiidid, eriti orto-asendajatega amiidid, üldiselt madala aktiivsusega (ainult üksikutel ensüümidel on parem katalüütiline toime).
Katalüütiline mehhanism:
| Ensüümid | Toote kood | Toote kood |
| Ensüümi pulber | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | komplekt 19 amidaasi, igaüks 50 mg 19 eset * 50 mg / tk või muu kogus |
| Screening Kit (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 amidaasi komplekt, igaüks 1 mg, 19 eset * 1 mg / tk |
★ Kõrge substraadi spetsiifilisus.
★ Tugev kiraalne selektiivsus.
★ Kõrge muundamise efektiivsus.
★ Vähem kõrvalsaadusi.
★ Kerged reaktsioonitingimused.
★ Keskkonnasõbralik.
➢ Substraadi spetsiifilisuse tõttu tuleks spetsiifiliste substraatide jaoks läbi viia ensüümide sõelumine ja saada ensüüm, mis katalüüsib sihtmärk-substraati parima katalüütilise toimega.
➢ Ärge kunagi puutuge kokku äärmuslike tingimustega, nagu kõrge temperatuur, kõrge/madal pH ja kõrge kontsentratsiooniga orgaaniline lahusti.
➢ Tavaliselt peaks reaktsioonisüsteem sisaldama substraati, puhverlahust (ensüümi optimaalne reaktsiooni pH).Atsüüliülekande reaktsioonisüsteemis peaksid olema kaassubstraadid, nagu hüdroksüülamiin.
➢ AMD tuleks lisada reaktsioonisüsteemi viimasena optimaalse reaktsiooni pH ja temperatuuriga.
➢ Kõikidel AMD-del on erinevad optimaalsed reaktsioonitingimused, nii et igaüht neist tuleks eraldi uurida.
Näide 1(1):
Hüdrolüüsi aktiivsus erinevatele amiidsubstraatidele
| Substraat | Konkreetne tegevus μmols min-1mg-1 | Substraat | Konkreetne tegevus μmols min-1mg-1 |
| Atseetamiid | 3.8 | ο-OH bensamiid | 1.4 |
| Propioonamiid | 3.9 | p-OH bensamiid | 1.2 |
| Laktamiid | 12.8 | ο-NH2bensamiid | 1.0 |
| butüramiid | 11.9 | p-NH2bensamiid | 0.8 |
| Isobutüramiid | 26.2 | ο- toluamiid | 0.3 |
| Pentaanamiid | 22.0 | p- toluamiid | 8.1 |
| Heksanamiid | 6.4 | Nikotiinamiid | 1.7 |
| Tsükloheksaanamiid | 19.5 | Isonikotiinamiid | 1.8 |
| Akrüülamiid | 10.2 | Pikolinamiid | 2.1 |
| metakrüülamiid | 3.5 | 3-fenüülpropioonamiid | 7.6 |
| proliinamiid | 3.4 | Indool-3-atseetamiid | 1.9 |
| Bensamiid | 6.8 |
Reaktsioon viidi läbi 50 mM naatriumfosfaadi puhverlahuses, pH 7,5, temperatuuril 70 ℃.
| Amiidid | Hüdroksüülamiin | Hüdrasiin |
| Atseetamiid | 8.4 | 1.4 |
| Propioonamiid | 18.4 | 3.0 |
| Isobutüramiid | 25.0 | 22.7 |
| Bensamiid | 9.2 | 6.1 |
Reaktsioon viidi läbi 50 mM naatriumfosfaadi puhverlahuses, pH 7,5, temperatuuril 70 ℃.
Seotud reaktiivi kontsentratsioon: amiidid, 100 mM (bensamiid, 10 mM);hüdroksüülamiin ja hüdrasiin, 400 mM;ensüüm 0,9 µM.
Näide 2(2):
Näide 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S. et al.Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR jt.Process Biochemistry, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM jt.Bioorgaaniline keemia, 2017, Internetis saadaval 7.
